Genjutsu jest to sztuka iluzji i hipnozy, stosowana tylko przez wykwalifikowanych w tym kierunku ninja. Techniki z tej dziedziny są często używane do przejęcia kontroli nad umysłem przeciwnika i wprowadzeniu go w stan dezorientacji, obłędu czy też uśpienia.

Plusy

- Koszt Czakry GenJutsu zmniejsza sie o 25%,
- Możesz wprowadzić przeciwnika w paraliżujące GenJutsu. To GenJutsu paraliżuje tylko ręce. Wystarczy spojrzeć przeciwnikowi w oczy. Wróg zachowuje jasność umysłu i może poruszać innymi częściami ciała. Tylko ręce się nie poruszają.

Minusy

- koszt nauki Taijutsu wzrasta o 50 % (zamiast jednego miejsca na jutsu trzeba poświecić 2)
- Koszt chaky Ninjutsu wzrasta o 10%.